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土壤轮作年限越长，微生物总含量越高。但微生物总含量的凹凸与土壤病原菌含量的凹凸并不呈正相关，病害发生轻或重的关键在于土壤微生物结构是否合理。蔬菜土壤跟着轮作年限的添加，土壤细菌添加，真菌的品种和数量削减。但有害真菌的品种和数量添加，放线菌随轮作年限的添加含量削减。这种土壤微生物结构的改动，使得蔬菜成长发育、质量等也发生改动。
土壤酶是土壤生物活性的一个重要目标，它们参加各种元素的生物循环、土壤有机物质的分化转化、腐殖质的构成等。土壤脲酶直接参加土壤中含N有机化合物的转化，脲酶活性随尿素施用量添加而增大。但土壤中脲酶活性过高，简单引起氨的蒸发丢失。因而，土壤应合理施用氮肥，操控脲酶活性，削减氮素丢失和对环境的污染；转化酶可使不能直接被植物吸收的蔗糖分化成葡萄糖和果糖，使土壤的生物活性进步。转化酶活性高，阐明土壤生物活性好，土壤肥力高。
化感效果是指植物或微生物的代谢活动对环境中其它植物或微生物所发生的有利或晦气的效果。研讨标明：豌豆、西红柿、黄瓜、西瓜和甜瓜植物根系分泌物和残茬中别离出一部分自毒物质，这些物质经过影响细胞膜透性、酶活性、离子吸收和光合效果等多种途径影响植物成长。
蔬菜轮作妨碍的首要防控办法：①不同的作物间进行轮作、间套种，土壤中的病原菌数量可明显减低。②施用生态有机肥，改动土壤微生物的构成。③使用天然降雨淋溶扫除盐分，削减盐分在土壤表层的堆集。每次洒水时应浇足浇透，将土表堆集的盐分稀释下淋，供根系吸收。④使用抗病品种和嫁接技能能够战胜病原菌的侵染。⑤使用一些有益菌对土壤中的特定病原菌发生有害物质或经过竞赛养分和空间等途径来削减病原菌的数量和根系的感染，然后削减病害。⑥某些微生物菌肥能拮抗某些病原微生物而发生按捺病害的效果。
由此可见，经过有用的农业培养准则和培养技能可有用地减轻由有害微生物引起的土壤轮作妨碍。
